Proprietário pode cobrar por 3 dias que fiquei com as chaves do imóvel?

Tem que ver que está no contrato e tiver no contrato o proprietário tem autonomia de cobrar sim.

Negocie com o proprietário.

Veja bem, não foi feito um contrato, mas parece que pelo descrito o motivo pessoal foi outro imóvel para alugar, tanto que no final é relatado que não tem mais o dinheiro para outro. Vamos lá, quando se pega uma chave de um imóvel de aluguel, o cliente já passa a ter responsabilidade sobre o imóvel. Automaticamente o proprietário já pode perder a oportunidade de fazer negócio com outra pessoa. Digamos que você tenha ido a uma empresa de aluguel de automóveis e retirado de lá um automóvel e ficou com ele parado por 3 dias em sua casa e resolveu devolver, vai ser cobrado as diárias ou não de você? No meu ponto de vista, se ponha no lugar do proprietário.

Sim ele pode descontar com multa recisoria.

Isso vai muito do carater de cada um, infelizmente não como opinar uma vez que não teve um contrato assinado.

Dê graças a Deus que ele descontou somente os 3 dias. Por lei ele poderia descontar além dos 3 dias, um aluguel integral porque contrato verbal é prazo indeterminado que exige notificação de desocupação 30 dias antes. Ao pegar as chaves você entrou na posse do imóvel e portanto o aluguel começa a correr. O locador não deve saber que pode te corbar um aluguel.

Muitas das vezes e possível pela obdiencia contratual mais o que prevalece e o bom senso.